“我想起来了……”沉睡的记忆与真相即将觉醒。故事以长野县为舞台，高人气角色“长野三人组”大和敢助、诸伏高明、上原由衣将登场亮相。当毛利小五郎警视厅时期同事“鳄鱼”遭遇意外，与致使大和敢助“独眼”的神秘 工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造不少间谍武器。为了防止犯罪团伙对 “赢得最棒的校园生活吧！”甘织怜子为了改变孤僻的初中生活，决心以全新形象开启高中生活。然而，由于天性内向，她无法完全适应理想中的“活跃型校园生活”，几乎喘不过气来。 以三位成员在肯尼亚的日常生活与任务挑战为主线，在非洲荒野背景下展现机智幽默与深厚友谊 
